Mô hình T7 DNA replisome

Mô hình bề mặt của phức hợp T7 replisome như được mô tả trong Gao và cộng sự, Science 10.1126/science.aav7003 (2019). Tất cả các thành phần được in riêng và dán lại với nhau. Các tiểu đơn vị protein được in bằng PLA, trong khi axit nucleic (DNA, RNA và dTTP) được in bằng TPU trắng. Phức hợp helicase từ mã PDB 6N7V được in màu xám, polymerase chuỗi dẫn đầu từ mã PDB 6N7w được in màu xanh lá cây và đồng, pol chuỗi theo sau từ mã PDB 6N9V được in màu đỏ, xanh dương và vàng. Tất cả các axit nucleic và các phối tử liên quan được in màu trắng. RNA được sơn màu đen và dTTP được sơn màu xanh dương. Một chuỗi DNA kép nhân tạo đã được tạo ra trong Chimera, hai chuỗi được in riêng biệt và được sử dụng để kết nối và lắp ráp các tiểu đơn vị (bao gồm cả vòng lặp chuỗi theo sau). Chuỗi DNA kép nhân tạo tương tự đã được in thêm 2 lần và được sử dụng để phóng to DNA khuôn, chuỗi dẫn đầu và chuỗi theo sau.

Tất cả các tệp in được cung cấp dưới dạng stl. Một tệp phiên .py có thể sử dụng trong Chimera cũng được cung cấp để hỗ trợ việc lắp ráp. Mô hình này được tạo ra để giúp tôi giảng dạy Hóa sinh và Sinh học Phân tử ở cấp độ đại học.

Phần mềm phân đoạn: Prusa Slicer

Phần mềm mô hình hóa/CAD 3D: Chimera

Nguồn gốc mô hình: Lai: dữ liệu + minh họa

Công nghệ/Vật liệu in: Polylactic Acid (PLA)/ Linh hoạt

Hãng/Mô hình máy in: Creality Ender 5 Pro

Đơn vị in: mm

Tỷ lệ tại đơn vị in đã cho: 100x

Chỉ dẫn tiền xử lý và hậu xử lý

In ở độ phân giải 0.2 với 2 đường viền và 5% độ đặc ruột. Máy in đã được sửa đổi với bộ đùn trục trực tiếp để có thể in TPU. Cần có giá đỡ rộng rãi nhưng tương đối dễ tháo gỡ.